ضدعفونی‌کننده‌های مرغداری نقش مهمی در کنترل و پیشگیری از بیماری‌های عفونی طیور دارند. این مواد با از بین بردن باکتری‌ها، ویروس‌ها و قارچ‌ها، محیط سالن را برای جوجه‌ها ایمن‌تر می‌کنند. انتخاب ضدعفونی‌کننده باید بر اساس نوع آلودگی، شرایط سالن و توصیه‌های بهداشتی انجام شود. استفاده منظم و صحیح از ضدعفونی‌کننده‌ها باعث کاهش تلفات و بهبود عملکرد گله می‌شود.
قبل از ضدعفونی، پاک‌سازی و شست‌وشوی اولیه محیط ضروری است تا اثربخشی مواد افزایش یابد.